在入門篇我們簡單介紹了使用automake自動產生makefile的幾個關鍵步驟，所有文件都在同一個目錄下。但在比較大的項目中，很少將所有文件放在一個目錄下的。本文針對這種情況做個簡單介紹。
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??? 多級目錄結構的軟件，一般是單個程序、庫文件或模塊放在各自的目錄中。automake要求每個目錄都有自己的Makefile.am文件來編譯各自目錄 下的代碼。在頂級的目錄中，有一個Makefile.am文件，該文件通過SUBDIRS指明了這個目錄下有多少個直接下級目錄的代碼需要編譯。下級目錄 的Makefile.am也指明自己需要編譯的下級目錄。通過這樣的層層遞歸i，從而完成多級目錄結構的編譯。
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??? 下面看一個具體的示例：
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??? 本例假設目錄結構如下：
??? helloworld???
??? |src
??? ||--test.cpp
??? ||dohello??
??? |||--dohello.h
??? |||--dohello.cpp
??? |doc
??? ||--userguide
??? 頂級目錄helloworld，該目錄下有src和doc兩個目錄。src目錄下有一個test.cpp文件，一個dohello目錄，dohello目錄下又有dohello.h和dohello.cpp兩個文件。doc下有一個readme文件。
??? 整個程序中test.cpp是主文件，里面有main函數。test.cpp調用了dohello.h和dohello.cpp中的類。
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??? 下面是編譯步驟：
???
??? 1.運行autoscan產生configure.scan???
??? 在頂級目錄helloworld下運行autoscan命令。產生configure.scan文件內容如下：
#??????????????? -*- Autoconf -*-
# Process this file with autoconf to produce a configure script.AC_PREREQ(2.61)
AC_INIT(FULL-PACKAGE-NAME, VERSION, BUG-REPORT-ADDRESS)
AC_CONFIG_SRCDIR([src/test.cpp])
AC_CONFIG_HEADER([config.h])
# Checks for programs.
AC_PROG_CXX
AC_PROG_CC
# Checks for libraries.
# Checks for header files.
# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
# Checks for library functions.
AC_CONFIG_FILES([Makefile
???????????????? src/Makefile
???????????????? src/dohello/Makefile])??????????????????????
AC_OUTPUT
???
???
??? 2.編輯configure.in
???
??? 將configure.scan改名成configure.in，然后修改如下：
# Process this file with autoconf to produce a configure script.
AC_PREREQ(2.61)
AC_INIT(hello,1.0)?? #軟件包名稱和版本號,另一種寫法是寫在AM_INIT_AUTOMAKE中.
AC_CONFIG_SRCDIR([src/test.cpp])
#AC_CONFIG_HEADER([config.h])
AM_INIT_AUTOMAKE
# Checks for programs.
AC_PROG_CXX
AC_PROG_CC
AC_PROG_RANLIB?????? #使用了靜態庫編譯,需要此宏定義
# Checks for libraries.
# Checks for header files.
# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
# Checks for library functions.
#AC_CONFIG_FILES([src/Makefile src/dohello/Makefile])
AC_OUTPUT(Makefile src/Makefile src/dohello/Makefile) #需要生成的Makefile，本例需要生成三個。
???
??? 3.運行aclocal和autoconf
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??? configure.in修改完后則先后執行aclocal和autoconf命令。
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??? 4.建立各個目錄的Makefile.am文件
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??? 在頂級目錄、src目錄和dohello目錄下分別建立三個Makefile.am文件。內容分別如下：
???
??? 頂級目錄Makefile.am：
#----------------開始------------------------------------------????
AUTOMAKE_OPTIONS=foreign
SUBDIRS=src?? #本目錄的直接下級目錄src需要編譯
EXTRA_DIST=doc/userguide #doc/userguide不需要編譯，但要發布該文件。如果有多個文件，則用空格分開。
#----------------結束------------------------------------------
???
??? src目錄下的Makefile.am：
#----------------開始------------------------------------------
AUTOMAKE_OPTIONS=foreign
SUBDIRS=dohello #本目錄的直接下級目錄dohello需要編譯
bin_PROGRAMS=hello #本目錄的文件編譯成可執行文件hello。如有多個，用空格分開。然后在下面分別寫它們的SOURCE和LDADD。
hello_SOURCES=test.cpp #編譯hello需要的源文件列表，如有多個，用空格分開。
hello_LDADD=dohello/libhello.a #編譯hello需要的庫文件列表。如有多個，用空格分開。
#----------------結束------------------------------------------
???
??? dohello目錄下的Makefile.am
#----------------開始------------------------------------------???
AUTOMAKE_OPTIONS=foreign
noinst_LIBRARIES=libhello.a?? #本目錄下的代碼編譯成libhello.a庫。不需要發布。如果需要發布，則寫成bin_LIBRARIES。注意，庫的名稱格式必需為 libxxx.a。因為編譯靜態庫，configure.in需要定義AC_PROG_RANLIB宏。
libhello_a_SOURCES=dohello.h dohello.cpp #編譯libhello.a需要的源文件。注意將庫名稱中的'.'號改成'_'號。
#----------------結束------------------------------------------
???
??? 5.運行automake
???
??? 以上幾個Makefile.am都書寫完畢后，運行automake --add-missing。
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??? 6.運行./configure和make
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??? 上面步驟完成后，先后運行./configure和make完成編譯。如果編譯成功，運行make dist可以將所有文件打包成hello-1.0.tar.gz。