試了一下，xmlDoc.save()行不同，就試著用fso做了出來。
整理一下，供大家discuss。

由于用js操作本地xml文件之后save時會permission denied，所以據我所知就只能通過FSO來做。而用FSO，基本上就與文件是否是xml無關。

xml文件：

<root>
? <parent>
??? <child1>one</child1>
??? <child2>one</child2>
? </parent>
? <parent>
??? <child1>two</child1>
??? <child2>two</child2>
? </parent>
? <parent>
??? ...
? </parent>
</root>

var temp;//要操作的數據

//添加節點
function add(root,parent,child1,child2){
?try{
??var fso = new ActiveXObject("Scripting.FileSystemObject");
??var fileOpen = fso.OpenTextFile("*.xml",1);
??var fileContent = fileOpen.ReadAll();
??fileOpen.close();

??if(fileContent.toString().indexOf(temp) !=-1){
???alert(temp+"was already in data.");
??}else{
???fileContent = fileContent.replace("</"+root+">","");
???fileContent += "<"+parent+"><"+child1+">";
???fileContent += ...;
???fileContent += "</"+child1+"><"+child2+">";
???fileContent += ...;
???fileContent += "</"+child2+"></"+parent+"></"+root+">";
???var fileWrite = fso.OpenTextFile("*.xml",2)
???fileWrite.write(fileContent);
???fileWrite.close();
???alert("add successfully!")
??}
?}catch(e){
??alert("fail to add.");
?}
}

//刪除節點
function del(root,parent,child1,child2){
?try{
??if( confirm("are you sure to delete symbol:"+temp+"?" ) ){
???var fso = new ActiveXObject("Scripting.FileSystemObject");
???var fileOpen = fso.OpenTextFile("*.xml",1);
???var fileContent = fileOpen.ReadAll();
???fileOpen.close();
???
???var parentArr = fileContent.split("</"+parent+">");
???var symbolPos = -2;//不一定是2，只要<0即可
???for (var i=0; i<parentArr.length-1; i++){
????if(parentArr[i].indexOf(temp) != -1){
????symbolPos = i;
????continue;
????}
????parentArr[i] += "</"+parent+">";?
???}
???if (symbolPos == -2){
????alert(temp+" not found in data.")
???}else{
????if(symbolPos == 0){
?????parentArr[0] = "<"+root+">";
????}else{
?????parentArr.splice(symbolPos,1);
????}
????fileContent = parentArr.toString().replace(/,/g,"")
????var fileWrite = fso.OpenTextFile("*.xml",2);
????fileWrite.write(fileContent);
????fileWrite.close();
????alert("deleted successfully!");
???}
??}
?}catch(e){
??alert("fail to delete.");
?}

基本思路：

添加節點
1：讀入原先xml文件所有字符，保存為fileContent;
2：去除根結點的封閉節點，即</root>;
3：fileContent += <parent><child1>..</child1><child2>...</child2></parent>;
4：fileContent += </root>;
5：寫入xml文件，關閉。
基本上就是用手動輸入來代替xml的CreateNode。

刪除節點
1：讀入原先xml文件所有字符，保存為fileContent;
2：以parent來分割fileContent，保存為parentArr[];
3：循環搜索parentArr[i]，利用indexOf(parentArr[i])來判斷要 刪除的節點里的內容 是否出現在parentArr[i];如果沒有找到，則parentArr[i] += parent用來補上split時丟失的parent；如果找到了，則不用 += parent, 并且記錄i的值;
4：parentArr.splice(i,1)，刪去節點；
5：parentArr.toString().replace(/,/g,"")，用來去除逗號;
6：寫入xml文件，關閉。

注意： 要注意split帶來的節點不易匹配的問題，所以 parentArr[i] += parent 時要小心。 當然split不一定按parent，哪個節點清晰就按哪個split。

看起來好像js操作本地文件沒什么意義，呵呵，不過由于看到好像沒有多少人用fso操作xml過，所以就試下，換換思路，平時fso用得也很少。歡迎批評指正~:D